Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FGD4Q96M96 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
FGD4Q96M96 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FGD4Q96M96 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FGD4Q96M96 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
FGD4Q96M96 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FGD4Q96M96 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
FGD4Q96M96 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FGD4Q96M96 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FGD4Q96M96 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FGD4Q96M96 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FGD4Q96M96 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FGD4Q96M96 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FGD4Q96M96 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FGD4Q96M96 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FGD4Q96M96 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FGD4Q96M96 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FGD4Q96M96 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FGD4Q96M96 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FGD4Q96M96 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FGD4Q96M96 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
FGD4Q96M96 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FGD4Q96M96 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FGD4Q96M96 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
FGD4Q96M96 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FGD4Q96M96 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
FGD4Q96M96 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FGD4Q96M96 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FGD4Q96M96 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FGD4Q96M96 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FGD4Q96M96 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
FGD4Q96M96 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FGD4Q96M96 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FGD4Q96M96 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms