Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms