Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
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SAMD8Q96LT4 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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SAMD8Q96LT4 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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SAMD8Q96LT4 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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SAMD8Q96LT4 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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SAMD8Q96LT4 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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SAMD8Q96LT4 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
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