Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SENP8Q96LD8 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SENP8Q96LD8 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SENP8Q96LD8 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SENP8Q96LD8 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SENP8Q96LD8 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SENP8Q96LD8 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SENP8Q96LD8 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SENP8Q96LD8 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SENP8Q96LD8 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SENP8Q96LD8 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SENP8Q96LD8 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SENP8Q96LD8 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SENP8Q96LD8 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SENP8Q96LD8 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SENP8Q96LD8 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SENP8Q96LD8 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SENP8Q96LD8 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SENP8Q96LD8 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SENP8Q96LD8 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SENP8Q96LD8 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SENP8Q96LD8 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SENP8Q96LD8 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SENP8Q96LD8 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SENP8Q96LD8 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SENP8Q96LD8 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SENP8Q96LD8 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SENP8Q96LD8 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SENP8Q96LD8 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SENP8Q96LD8 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SENP8Q96LD8 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SENP8Q96LD8 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SENP8Q96LD8 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SENP8Q96LD8 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SENP8Q96LD8 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SENP8Q96LD8 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SENP8Q96LD8 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SENP8Q96LD8 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SENP8Q96LD8 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SENP8Q96LD8 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SENP8Q96LD8 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SENP8Q96LD8 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SENP8Q96LD8 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SENP8Q96LD8 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SENP8Q96LD8 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SENP8Q96LD8 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SENP8Q96LD8 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SENP8Q96LD8 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SENP8Q96LD8 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SENP8Q96LD8 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SENP8Q96LD8 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SENP8Q96LD8 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SENP8Q96LD8 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SENP8Q96LD8 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SENP8Q96LD8 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SENP8Q96LD8 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SENP8Q96LD8 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SENP8Q96LD8 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SENP8Q96LD8 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SENP8Q96LD8 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SENP8Q96LD8 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SENP8Q96LD8 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SENP8Q96LD8 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SENP8Q96LD8 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SENP8Q96LD8 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SENP8Q96LD8 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SENP8Q96LD8 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SENP8Q96LD8 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SENP8Q96LD8 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SENP8Q96LD8 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SENP8Q96LD8 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SENP8Q96LD8 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SENP8Q96LD8 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SENP8Q96LD8 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SENP8Q96LD8 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SENP8Q96LD8 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SENP8Q96LD8 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SENP8Q96LD8 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SENP8Q96LD8 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SENP8Q96LD8 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SENP8Q96LD8 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SENP8Q96LD8 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SENP8Q96LD8 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SENP8Q96LD8 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SENP8Q96LD8 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SENP8Q96LD8 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SENP8Q96LD8 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SENP8Q96LD8 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SENP8Q96LD8 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SENP8Q96LD8 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SENP8Q96LD8 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SENP8Q96LD8 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SENP8Q96LD8 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SENP8Q96LD8 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SENP8Q96LD8 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SENP8Q96LD8 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SENP8Q96LD8 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SENP8Q96LD8 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SENP8Q96LD8 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SENP8Q96LD8 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms