Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HIC2Q96JB3 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HIC2Q96JB3 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HIC2Q96JB3 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HIC2Q96JB3 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HIC2Q96JB3 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HIC2Q96JB3 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HIC2Q96JB3 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HIC2Q96JB3 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HIC2Q96JB3 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HIC2Q96JB3 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HIC2Q96JB3 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HIC2Q96JB3 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HIC2Q96JB3 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HIC2Q96JB3 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HIC2Q96JB3 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HIC2Q96JB3 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HIC2Q96JB3 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HIC2Q96JB3 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HIC2Q96JB3 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HIC2Q96JB3 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HIC2Q96JB3 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HIC2Q96JB3 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HIC2Q96JB3 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HIC2Q96JB3 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HIC2Q96JB3 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HIC2Q96JB3 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HIC2Q96JB3 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HIC2Q96JB3 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HIC2Q96JB3 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HIC2Q96JB3 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HIC2Q96JB3 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HIC2Q96JB3 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HIC2Q96JB3 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HIC2Q96JB3 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HIC2Q96JB3 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HIC2Q96JB3 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HIC2Q96JB3 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIC2Q96JB3 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HIC2Q96JB3 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIC2Q96JB3 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIC2Q96JB3 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIC2Q96JB3 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIC2Q96JB3 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIC2Q96JB3 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIC2Q96JB3 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIC2Q96JB3 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIC2Q96JB3 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIC2Q96JB3 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIC2Q96JB3 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIC2Q96JB3 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HIC2Q96JB3 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIC2Q96JB3 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIC2Q96JB3 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIC2Q96JB3 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIC2Q96JB3 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIC2Q96JB3 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIC2Q96JB3 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIC2Q96JB3 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIC2Q96JB3 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIC2Q96JB3 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIC2Q96JB3 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIC2Q96JB3 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIC2Q96JB3 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIC2Q96JB3 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIC2Q96JB3 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIC2Q96JB3 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIC2Q96JB3 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIC2Q96JB3 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIC2Q96JB3 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIC2Q96JB3 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIC2Q96JB3 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HIC2Q96JB3 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIC2Q96JB3 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIC2Q96JB3 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIC2Q96JB3 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIC2Q96JB3 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIC2Q96JB3 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIC2Q96JB3 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIC2Q96JB3 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIC2Q96JB3 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIC2Q96JB3 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIC2Q96JB3 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIC2Q96JB3 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIC2Q96JB3 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIC2Q96JB3 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIC2Q96JB3 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIC2Q96JB3 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms