Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms