Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNFT2Q96EX2 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.9 ms