Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ9

CMTM5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM5Q96DZ9 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CMTM5Q96DZ9 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CMTM5Q96DZ9 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CMTM5Q96DZ9 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CMTM5Q96DZ9 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CMTM5Q96DZ9 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CMTM5Q96DZ9 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CMTM5Q96DZ9 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CMTM5Q96DZ9 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CMTM5Q96DZ9 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CMTM5Q96DZ9 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CMTM5Q96DZ9 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CMTM5Q96DZ9 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CMTM5Q96DZ9 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CMTM5Q96DZ9 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CMTM5Q96DZ9 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CMTM5Q96DZ9 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CMTM5Q96DZ9 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CMTM5Q96DZ9 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CMTM5Q96DZ9 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CMTM5Q96DZ9 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CMTM5Q96DZ9 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CMTM5Q96DZ9 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CMTM5Q96DZ9 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CMTM5Q96DZ9 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CMTM5Q96DZ9 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CMTM5Q96DZ9 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CMTM5Q96DZ9 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CMTM5Q96DZ9 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CMTM5Q96DZ9 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CMTM5Q96DZ9 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CMTM5Q96DZ9 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CMTM5Q96DZ9 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CMTM5Q96DZ9 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CMTM5Q96DZ9 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CMTM5Q96DZ9 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CMTM5Q96DZ9 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CMTM5Q96DZ9 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CMTM5Q96DZ9 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CMTM5Q96DZ9 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CMTM5Q96DZ9 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CMTM5Q96DZ9 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CMTM5Q96DZ9 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CMTM5Q96DZ9 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CMTM5Q96DZ9 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CMTM5Q96DZ9 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CMTM5Q96DZ9 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CMTM5Q96DZ9 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms