Protein–RNA interactions for Protein: Q96CX2

KCTD12, BTB/POZ domain-containing protein KCTD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD12Q96CX2 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCTD12Q96CX2 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCTD12Q96CX2 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCTD12Q96CX2 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCTD12Q96CX2 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCTD12Q96CX2 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCTD12Q96CX2 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCTD12Q96CX2 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCTD12Q96CX2 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCTD12Q96CX2 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCTD12Q96CX2 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCTD12Q96CX2 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCTD12Q96CX2 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCTD12Q96CX2 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCTD12Q96CX2 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCTD12Q96CX2 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCTD12Q96CX2 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCTD12Q96CX2 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCTD12Q96CX2 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCTD12Q96CX2 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCTD12Q96CX2 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCTD12Q96CX2 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCTD12Q96CX2 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCTD12Q96CX2 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCTD12Q96CX2 AC113382.2-201ENST00000506911 646 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCTD12Q96CX2 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCTD12Q96CX2 AC115837.2-201ENST00000522127 677 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCTD12Q96CX2 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCTD12Q96CX2 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCTD12Q96CX2 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCTD12Q96CX2 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 MYL10-201ENST00000223167 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 AP001542.1-201ENST00000591314 200 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 AC010422.1-201ENST00000414548 543 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 AC008080.4-202ENST00000440034 1005 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms