Protein–RNA interactions for Protein: Q96CF2

CHMP4C, Charged multivesicular body protein 4c, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4CQ96CF2 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHMP4CQ96CF2 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHMP4CQ96CF2 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHMP4CQ96CF2 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHMP4CQ96CF2 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHMP4CQ96CF2 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CHMP4CQ96CF2 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHMP4CQ96CF2 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHMP4CQ96CF2 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CHMP4CQ96CF2 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHMP4CQ96CF2 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHMP4CQ96CF2 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHMP4CQ96CF2 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHMP4CQ96CF2 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHMP4CQ96CF2 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHMP4CQ96CF2 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHMP4CQ96CF2 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHMP4CQ96CF2 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHMP4CQ96CF2 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHMP4CQ96CF2 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHMP4CQ96CF2 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHMP4CQ96CF2 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHMP4CQ96CF2 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHMP4CQ96CF2 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHMP4CQ96CF2 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CHMP4CQ96CF2 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHMP4CQ96CF2 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHMP4CQ96CF2 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHMP4CQ96CF2 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHMP4CQ96CF2 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHMP4CQ96CF2 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHMP4CQ96CF2 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHMP4CQ96CF2 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHMP4CQ96CF2 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHMP4CQ96CF2 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHMP4CQ96CF2 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHMP4CQ96CF2 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHMP4CQ96CF2 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHMP4CQ96CF2 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHMP4CQ96CF2 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHMP4CQ96CF2 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHMP4CQ96CF2 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHMP4CQ96CF2 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHMP4CQ96CF2 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CHMP4CQ96CF2 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CHMP4CQ96CF2 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CHMP4CQ96CF2 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHMP4CQ96CF2 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHMP4CQ96CF2 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHMP4CQ96CF2 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHMP4CQ96CF2 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHMP4CQ96CF2 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHMP4CQ96CF2 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHMP4CQ96CF2 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHMP4CQ96CF2 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHMP4CQ96CF2 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHMP4CQ96CF2 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHMP4CQ96CF2 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHMP4CQ96CF2 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHMP4CQ96CF2 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHMP4CQ96CF2 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHMP4CQ96CF2 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHMP4CQ96CF2 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHMP4CQ96CF2 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHMP4CQ96CF2 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHMP4CQ96CF2 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHMP4CQ96CF2 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMP4CQ96CF2 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMP4CQ96CF2 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMP4CQ96CF2 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMP4CQ96CF2 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMP4CQ96CF2 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMP4CQ96CF2 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMP4CQ96CF2 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMP4CQ96CF2 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMP4CQ96CF2 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMP4CQ96CF2 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMP4CQ96CF2 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMP4CQ96CF2 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMP4CQ96CF2 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMP4CQ96CF2 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMP4CQ96CF2 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMP4CQ96CF2 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMP4CQ96CF2 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMP4CQ96CF2 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMP4CQ96CF2 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CHMP4CQ96CF2 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms