Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms