Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNAAF4Q8WXU2 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms