Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCG3Q8WXD2 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCG3Q8WXD2 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCG3Q8WXD2 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCG3Q8WXD2 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCG3Q8WXD2 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCG3Q8WXD2 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCG3Q8WXD2 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCG3Q8WXD2 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SCG3Q8WXD2 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCG3Q8WXD2 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCG3Q8WXD2 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCG3Q8WXD2 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCG3Q8WXD2 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCG3Q8WXD2 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SCG3Q8WXD2 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCG3Q8WXD2 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCG3Q8WXD2 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCG3Q8WXD2 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCG3Q8WXD2 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCG3Q8WXD2 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCG3Q8WXD2 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCG3Q8WXD2 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCG3Q8WXD2 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCG3Q8WXD2 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCG3Q8WXD2 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCG3Q8WXD2 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCG3Q8WXD2 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCG3Q8WXD2 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCG3Q8WXD2 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCG3Q8WXD2 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCG3Q8WXD2 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCG3Q8WXD2 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCG3Q8WXD2 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCG3Q8WXD2 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCG3Q8WXD2 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCG3Q8WXD2 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCG3Q8WXD2 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCG3Q8WXD2 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCG3Q8WXD2 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SCG3Q8WXD2 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SCG3Q8WXD2 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SCG3Q8WXD2 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCG3Q8WXD2 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCG3Q8WXD2 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCG3Q8WXD2 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCG3Q8WXD2 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCG3Q8WXD2 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SCG3Q8WXD2 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCG3Q8WXD2 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCG3Q8WXD2 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCG3Q8WXD2 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCG3Q8WXD2 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCG3Q8WXD2 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCG3Q8WXD2 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCG3Q8WXD2 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCG3Q8WXD2 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCG3Q8WXD2 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCG3Q8WXD2 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCG3Q8WXD2 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCG3Q8WXD2 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCG3Q8WXD2 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCG3Q8WXD2 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCG3Q8WXD2 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCG3Q8WXD2 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SCG3Q8WXD2 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCG3Q8WXD2 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCG3Q8WXD2 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCG3Q8WXD2 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCG3Q8WXD2 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCG3Q8WXD2 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCG3Q8WXD2 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCG3Q8WXD2 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCG3Q8WXD2 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCG3Q8WXD2 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCG3Q8WXD2 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCG3Q8WXD2 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCG3Q8WXD2 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCG3Q8WXD2 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCG3Q8WXD2 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
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