Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms