Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms