Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF397Q8NF99 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF397Q8NF99 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF397Q8NF99 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF397Q8NF99 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF397Q8NF99 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF397Q8NF99 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF397Q8NF99 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF397Q8NF99 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF397Q8NF99 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF397Q8NF99 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF397Q8NF99 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF397Q8NF99 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF397Q8NF99 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF397Q8NF99 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF397Q8NF99 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF397Q8NF99 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF397Q8NF99 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF397Q8NF99 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF397Q8NF99 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF397Q8NF99 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF397Q8NF99 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF397Q8NF99 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF397Q8NF99 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF397Q8NF99 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF397Q8NF99 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF397Q8NF99 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF397Q8NF99 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF397Q8NF99 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF397Q8NF99 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF397Q8NF99 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF397Q8NF99 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF397Q8NF99 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF397Q8NF99 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF397Q8NF99 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF397Q8NF99 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF397Q8NF99 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF397Q8NF99 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF397Q8NF99 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF397Q8NF99 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF397Q8NF99 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF397Q8NF99 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF397Q8NF99 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF397Q8NF99 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF397Q8NF99 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF397Q8NF99 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF397Q8NF99 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF397Q8NF99 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF397Q8NF99 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF397Q8NF99 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF397Q8NF99 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF397Q8NF99 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF397Q8NF99 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF397Q8NF99 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF397Q8NF99 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF397Q8NF99 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF397Q8NF99 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF397Q8NF99 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF397Q8NF99 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF397Q8NF99 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF397Q8NF99 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF397Q8NF99 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF397Q8NF99 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF397Q8NF99 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF397Q8NF99 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF397Q8NF99 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF397Q8NF99 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF397Q8NF99 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF397Q8NF99 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF397Q8NF99 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF397Q8NF99 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF397Q8NF99 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF397Q8NF99 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF397Q8NF99 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF397Q8NF99 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF397Q8NF99 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF397Q8NF99 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF397Q8NF99 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF397Q8NF99 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF397Q8NF99 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF397Q8NF99 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF397Q8NF99 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF397Q8NF99 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF397Q8NF99 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF397Q8NF99 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF397Q8NF99 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF397Q8NF99 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF397Q8NF99 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF397Q8NF99 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF397Q8NF99 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF397Q8NF99 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF397Q8NF99 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF397Q8NF99 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF397Q8NF99 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF397Q8NF99 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF397Q8NF99 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF397Q8NF99 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF397Q8NF99 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF397Q8NF99 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF397Q8NF99 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms