Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
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