Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms