Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms