Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00301Q8NCQ3 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms