Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms