Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8U3

RTL3, Retrotransposon Gag-like protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL3Q8N8U3 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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