Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6G1

LINC00337, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00337, humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00337Q8N6G1 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms