Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms