Protein–RNA interactions for Protein: Q86VZ4

LRP11, Low-density lipoprotein receptor-related protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP11Q86VZ4 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRP11Q86VZ4 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRP11Q86VZ4 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRP11Q86VZ4 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRP11Q86VZ4 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRP11Q86VZ4 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRP11Q86VZ4 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRP11Q86VZ4 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRP11Q86VZ4 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRP11Q86VZ4 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRP11Q86VZ4 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRP11Q86VZ4 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRP11Q86VZ4 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRP11Q86VZ4 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRP11Q86VZ4 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRP11Q86VZ4 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRP11Q86VZ4 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRP11Q86VZ4 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRP11Q86VZ4 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRP11Q86VZ4 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRP11Q86VZ4 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRP11Q86VZ4 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRP11Q86VZ4 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRP11Q86VZ4 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRP11Q86VZ4 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRP11Q86VZ4 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRP11Q86VZ4 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRP11Q86VZ4 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRP11Q86VZ4 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRP11Q86VZ4 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRP11Q86VZ4 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRP11Q86VZ4 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRP11Q86VZ4 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRP11Q86VZ4 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRP11Q86VZ4 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LRP11Q86VZ4 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRP11Q86VZ4 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRP11Q86VZ4 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRP11Q86VZ4 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LRP11Q86VZ4 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LRP11Q86VZ4 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRP11Q86VZ4 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LRP11Q86VZ4 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRP11Q86VZ4 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRP11Q86VZ4 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRP11Q86VZ4 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRP11Q86VZ4 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRP11Q86VZ4 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRP11Q86VZ4 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRP11Q86VZ4 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRP11Q86VZ4 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRP11Q86VZ4 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRP11Q86VZ4 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRP11Q86VZ4 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRP11Q86VZ4 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRP11Q86VZ4 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRP11Q86VZ4 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRP11Q86VZ4 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRP11Q86VZ4 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRP11Q86VZ4 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRP11Q86VZ4 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRP11Q86VZ4 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRP11Q86VZ4 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRP11Q86VZ4 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRP11Q86VZ4 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRP11Q86VZ4 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRP11Q86VZ4 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRP11Q86VZ4 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRP11Q86VZ4 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRP11Q86VZ4 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LRP11Q86VZ4 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LRP11Q86VZ4 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRP11Q86VZ4 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRP11Q86VZ4 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRP11Q86VZ4 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRP11Q86VZ4 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LRP11Q86VZ4 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRP11Q86VZ4 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRP11Q86VZ4 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRP11Q86VZ4 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRP11Q86VZ4 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRP11Q86VZ4 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRP11Q86VZ4 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRP11Q86VZ4 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LRP11Q86VZ4 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRP11Q86VZ4 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRP11Q86VZ4 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LRP11Q86VZ4 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRP11Q86VZ4 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRP11Q86VZ4 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRP11Q86VZ4 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRP11Q86VZ4 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRP11Q86VZ4 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRP11Q86VZ4 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRP11Q86VZ4 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRP11Q86VZ4 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRP11Q86VZ4 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRP11Q86VZ4 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRP11Q86VZ4 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRP11Q86VZ4 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms