Protein–RNA interactions for Protein: Q86VB7

CD163, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M130, humanhuman

Predictions only

Length 1,156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD163Q86VB7 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms