Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3C6

ATG9A, Autophagy-related protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9AQ7Z3C6 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms