Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms