Protein–RNA interactions for Protein: Q71RG4

TMUB2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2Q71RG4 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TMUB2Q71RG4 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TMUB2Q71RG4 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TMUB2Q71RG4 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TMUB2Q71RG4 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TMUB2Q71RG4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TMUB2Q71RG4 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TMUB2Q71RG4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TMUB2Q71RG4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TMUB2Q71RG4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TMUB2Q71RG4 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TMUB2Q71RG4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TMUB2Q71RG4 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TMUB2Q71RG4 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TMUB2Q71RG4 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TMUB2Q71RG4 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TMUB2Q71RG4 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TMUB2Q71RG4 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TMUB2Q71RG4 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TMUB2Q71RG4 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TMUB2Q71RG4 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TMUB2Q71RG4 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TMUB2Q71RG4 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TMUB2Q71RG4 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TMUB2Q71RG4 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TMUB2Q71RG4 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TMUB2Q71RG4 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TMUB2Q71RG4 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TMUB2Q71RG4 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TMUB2Q71RG4 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TMUB2Q71RG4 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMUB2Q71RG4 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMUB2Q71RG4 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMUB2Q71RG4 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMUB2Q71RG4 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMUB2Q71RG4 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMUB2Q71RG4 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMUB2Q71RG4 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMUB2Q71RG4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMUB2Q71RG4 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMUB2Q71RG4 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMUB2Q71RG4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TMUB2Q71RG4 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TMUB2Q71RG4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TMUB2Q71RG4 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMUB2Q71RG4 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMUB2Q71RG4 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMUB2Q71RG4 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMUB2Q71RG4 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMUB2Q71RG4 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMUB2Q71RG4 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMUB2Q71RG4 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMUB2Q71RG4 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMUB2Q71RG4 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMUB2Q71RG4 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMUB2Q71RG4 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMUB2Q71RG4 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMUB2Q71RG4 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMUB2Q71RG4 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMUB2Q71RG4 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMUB2Q71RG4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMUB2Q71RG4 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMUB2Q71RG4 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMUB2Q71RG4 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMUB2Q71RG4 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMUB2Q71RG4 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMUB2Q71RG4 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMUB2Q71RG4 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMUB2Q71RG4 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMUB2Q71RG4 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMUB2Q71RG4 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMUB2Q71RG4 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMUB2Q71RG4 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMUB2Q71RG4 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMUB2Q71RG4 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMUB2Q71RG4 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMUB2Q71RG4 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMUB2Q71RG4 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMUB2Q71RG4 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMUB2Q71RG4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMUB2Q71RG4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMUB2Q71RG4 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMUB2Q71RG4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMUB2Q71RG4 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMUB2Q71RG4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMUB2Q71RG4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMUB2Q71RG4 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMUB2Q71RG4 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMUB2Q71RG4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMUB2Q71RG4 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMUB2Q71RG4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMUB2Q71RG4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMUB2Q71RG4 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMUB2Q71RG4 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMUB2Q71RG4 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMUB2Q71RG4 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMUB2Q71RG4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMUB2Q71RG4 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMUB2Q71RG4 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMUB2Q71RG4 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms