Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms