Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZR52

ZNF493, Zinc finger protein 493, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF493Q6ZR52 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ZNF493Q6ZR52 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms