Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQX7

LIAT1, Protein LIAT1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIAT1Q6ZQX7 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms