Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms