Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4Q7

CNNM4, Metal transporter CNNM4, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM4Q6P4Q7 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNNM4Q6P4Q7 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNNM4Q6P4Q7 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNNM4Q6P4Q7 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNNM4Q6P4Q7 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNNM4Q6P4Q7 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNNM4Q6P4Q7 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNNM4Q6P4Q7 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNNM4Q6P4Q7 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNNM4Q6P4Q7 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNNM4Q6P4Q7 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNNM4Q6P4Q7 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNNM4Q6P4Q7 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNNM4Q6P4Q7 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNNM4Q6P4Q7 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNNM4Q6P4Q7 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNNM4Q6P4Q7 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNNM4Q6P4Q7 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNNM4Q6P4Q7 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNNM4Q6P4Q7 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNNM4Q6P4Q7 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNNM4Q6P4Q7 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNNM4Q6P4Q7 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNNM4Q6P4Q7 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNNM4Q6P4Q7 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNNM4Q6P4Q7 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNNM4Q6P4Q7 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNNM4Q6P4Q7 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNNM4Q6P4Q7 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNNM4Q6P4Q7 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNNM4Q6P4Q7 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNNM4Q6P4Q7 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CNNM4Q6P4Q7 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNNM4Q6P4Q7 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNNM4Q6P4Q7 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CNNM4Q6P4Q7 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNNM4Q6P4Q7 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CNNM4Q6P4Q7 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNNM4Q6P4Q7 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CNNM4Q6P4Q7 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNNM4Q6P4Q7 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNNM4Q6P4Q7 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNNM4Q6P4Q7 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNNM4Q6P4Q7 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNNM4Q6P4Q7 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNNM4Q6P4Q7 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNNM4Q6P4Q7 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNNM4Q6P4Q7 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNNM4Q6P4Q7 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CNNM4Q6P4Q7 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CNNM4Q6P4Q7 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CNNM4Q6P4Q7 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CNNM4Q6P4Q7 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CNNM4Q6P4Q7 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CNNM4Q6P4Q7 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CNNM4Q6P4Q7 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CNNM4Q6P4Q7 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CNNM4Q6P4Q7 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CNNM4Q6P4Q7 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CNNM4Q6P4Q7 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNNM4Q6P4Q7 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNNM4Q6P4Q7 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNNM4Q6P4Q7 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNNM4Q6P4Q7 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNNM4Q6P4Q7 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNNM4Q6P4Q7 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNNM4Q6P4Q7 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNNM4Q6P4Q7 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNNM4Q6P4Q7 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNNM4Q6P4Q7 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNNM4Q6P4Q7 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNNM4Q6P4Q7 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNNM4Q6P4Q7 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNNM4Q6P4Q7 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNNM4Q6P4Q7 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNNM4Q6P4Q7 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CNNM4Q6P4Q7 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CNNM4Q6P4Q7 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNNM4Q6P4Q7 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNNM4Q6P4Q7 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNNM4Q6P4Q7 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNNM4Q6P4Q7 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNNM4Q6P4Q7 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNNM4Q6P4Q7 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNNM4Q6P4Q7 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNNM4Q6P4Q7 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNNM4Q6P4Q7 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNNM4Q6P4Q7 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNNM4Q6P4Q7 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNNM4Q6P4Q7 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNNM4Q6P4Q7 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNNM4Q6P4Q7 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNNM4Q6P4Q7 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNNM4Q6P4Q7 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNNM4Q6P4Q7 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNNM4Q6P4Q7 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CNNM4Q6P4Q7 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNNM4Q6P4Q7 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNNM4Q6P4Q7 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNNM4Q6P4Q7 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms