Protein–RNA interactions for Protein: Q6NX49

ZNF544, Zinc finger protein 544, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF544Q6NX49 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms