Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms