Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CREB3L3Q68CJ9 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms