Protein–RNA interactions for Protein: Q60I27

ALS2CL, ALS2 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CLQ60I27 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALS2CLQ60I27 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALS2CLQ60I27 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALS2CLQ60I27 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALS2CLQ60I27 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALS2CLQ60I27 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALS2CLQ60I27 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALS2CLQ60I27 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALS2CLQ60I27 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALS2CLQ60I27 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALS2CLQ60I27 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALS2CLQ60I27 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALS2CLQ60I27 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALS2CLQ60I27 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALS2CLQ60I27 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ALS2CLQ60I27 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALS2CLQ60I27 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALS2CLQ60I27 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALS2CLQ60I27 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALS2CLQ60I27 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALS2CLQ60I27 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALS2CLQ60I27 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALS2CLQ60I27 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ALS2CLQ60I27 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALS2CLQ60I27 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALS2CLQ60I27 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALS2CLQ60I27 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALS2CLQ60I27 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALS2CLQ60I27 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALS2CLQ60I27 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALS2CLQ60I27 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALS2CLQ60I27 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALS2CLQ60I27 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALS2CLQ60I27 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALS2CLQ60I27 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALS2CLQ60I27 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALS2CLQ60I27 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALS2CLQ60I27 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALS2CLQ60I27 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALS2CLQ60I27 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALS2CLQ60I27 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALS2CLQ60I27 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALS2CLQ60I27 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALS2CLQ60I27 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALS2CLQ60I27 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALS2CLQ60I27 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALS2CLQ60I27 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALS2CLQ60I27 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALS2CLQ60I27 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALS2CLQ60I27 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALS2CLQ60I27 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALS2CLQ60I27 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALS2CLQ60I27 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALS2CLQ60I27 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALS2CLQ60I27 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALS2CLQ60I27 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALS2CLQ60I27 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALS2CLQ60I27 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALS2CLQ60I27 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALS2CLQ60I27 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALS2CLQ60I27 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALS2CLQ60I27 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALS2CLQ60I27 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALS2CLQ60I27 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALS2CLQ60I27 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALS2CLQ60I27 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALS2CLQ60I27 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALS2CLQ60I27 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALS2CLQ60I27 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALS2CLQ60I27 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALS2CLQ60I27 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALS2CLQ60I27 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALS2CLQ60I27 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALS2CLQ60I27 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALS2CLQ60I27 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALS2CLQ60I27 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALS2CLQ60I27 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALS2CLQ60I27 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALS2CLQ60I27 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALS2CLQ60I27 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALS2CLQ60I27 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALS2CLQ60I27 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALS2CLQ60I27 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALS2CLQ60I27 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALS2CLQ60I27 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALS2CLQ60I27 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALS2CLQ60I27 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALS2CLQ60I27 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALS2CLQ60I27 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALS2CLQ60I27 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ALS2CLQ60I27 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ALS2CLQ60I27 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ALS2CLQ60I27 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALS2CLQ60I27 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALS2CLQ60I27 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALS2CLQ60I27 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALS2CLQ60I27 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALS2CLQ60I27 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALS2CLQ60I27 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALS2CLQ60I27 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms