Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
RNF20Q5VTR2 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms