Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms