Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms