Protein–RNA interactions for Protein: Q5QFB9

PAPPA-AS1, Protein PAPPAS, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPPA-AS1Q5QFB9 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PAPPA-AS1Q5QFB9 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PAPPA-AS1Q5QFB9 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PAPPA-AS1Q5QFB9 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
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PAPPA-AS1Q5QFB9 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PAPPA-AS1Q5QFB9 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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PAPPA-AS1Q5QFB9 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PAPPA-AS1Q5QFB9 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
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PAPPA-AS1Q5QFB9 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PAPPA-AS1Q5QFB9 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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