Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms