Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms