Protein–RNA interactions for Protein: Q562R1

ACTBL2, Beta-actin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBL2Q562R1 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms