Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms