Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms