Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms