Protein–RNA interactions for Protein: Q4W5N1

ABCA11P, Putative ATP-binding cassette sub-family A member 11, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCA11PQ4W5N1 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ABCA11PQ4W5N1 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ABCA11PQ4W5N1 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCA11PQ4W5N1 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCA11PQ4W5N1 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCA11PQ4W5N1 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCA11PQ4W5N1 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCA11PQ4W5N1 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCA11PQ4W5N1 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCA11PQ4W5N1 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCA11PQ4W5N1 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCA11PQ4W5N1 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCA11PQ4W5N1 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCA11PQ4W5N1 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCA11PQ4W5N1 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCA11PQ4W5N1 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCA11PQ4W5N1 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCA11PQ4W5N1 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCA11PQ4W5N1 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCA11PQ4W5N1 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCA11PQ4W5N1 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCA11PQ4W5N1 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCA11PQ4W5N1 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCA11PQ4W5N1 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCA11PQ4W5N1 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCA11PQ4W5N1 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCA11PQ4W5N1 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCA11PQ4W5N1 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCA11PQ4W5N1 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCA11PQ4W5N1 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCA11PQ4W5N1 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCA11PQ4W5N1 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCA11PQ4W5N1 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCA11PQ4W5N1 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCA11PQ4W5N1 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCA11PQ4W5N1 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCA11PQ4W5N1 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCA11PQ4W5N1 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCA11PQ4W5N1 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCA11PQ4W5N1 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCA11PQ4W5N1 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCA11PQ4W5N1 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCA11PQ4W5N1 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCA11PQ4W5N1 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCA11PQ4W5N1 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCA11PQ4W5N1 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCA11PQ4W5N1 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCA11PQ4W5N1 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCA11PQ4W5N1 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCA11PQ4W5N1 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCA11PQ4W5N1 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCA11PQ4W5N1 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCA11PQ4W5N1 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCA11PQ4W5N1 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCA11PQ4W5N1 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCA11PQ4W5N1 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCA11PQ4W5N1 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCA11PQ4W5N1 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCA11PQ4W5N1 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCA11PQ4W5N1 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCA11PQ4W5N1 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCA11PQ4W5N1 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCA11PQ4W5N1 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCA11PQ4W5N1 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCA11PQ4W5N1 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCA11PQ4W5N1 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCA11PQ4W5N1 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCA11PQ4W5N1 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCA11PQ4W5N1 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCA11PQ4W5N1 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCA11PQ4W5N1 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCA11PQ4W5N1 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCA11PQ4W5N1 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCA11PQ4W5N1 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCA11PQ4W5N1 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCA11PQ4W5N1 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCA11PQ4W5N1 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCA11PQ4W5N1 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCA11PQ4W5N1 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCA11PQ4W5N1 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCA11PQ4W5N1 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCA11PQ4W5N1 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCA11PQ4W5N1 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCA11PQ4W5N1 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCA11PQ4W5N1 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCA11PQ4W5N1 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCA11PQ4W5N1 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCA11PQ4W5N1 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCA11PQ4W5N1 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCA11PQ4W5N1 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCA11PQ4W5N1 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCA11PQ4W5N1 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCA11PQ4W5N1 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCA11PQ4W5N1 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCA11PQ4W5N1 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCA11PQ4W5N1 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCA11PQ4W5N1 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCA11PQ4W5N1 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCA11PQ4W5N1 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCA11PQ4W5N1 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms