Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI81

KRTAP27-1, Keratin-associated protein 27-1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP27-1Q3LI81 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms